丽水学院档案馆历史源于1991年成立的丽水师范专科学校档案室，2004年5月丽水师范专科学校升格本科院校后，发展为丽水学院档案室，2011 年 9 月升格为档案馆，隶属于院长办公室，2014年划归学校图书馆，2017年图书馆与信息中心合并，成立图书与信息服务中心。档案馆集中管理全校各种门类的档案，对全校档案工作进行全面规划、组织、指导和监督，现有专职档案员3名，另有兼职档案员54名。
档案馆主馆舍位于求是楼（行政楼）4楼，面积190平方米，于2002年启用，2021年新增东区15号楼一楼库房，面积约190平米。档案馆基础设施完备，配备了档案柜、防磁柜、空调器、去湿机、计算机、复印机、数码相机、扫描仪、监控设备等现代化装具和设备。
档案馆馆藏档案始于1949年。截止2023年底，馆藏8个全宗（即丽水学院、丽水师范专科学校、丽水职业技术学院、浙江省少数民族师范学校、国防工业技校、丽水工业学校、丽水农业学校、丽水卫生学校）档案共计31458卷。2014年，档案馆启动数字档案馆建设，引入“南大之星”档案管理系统，开展数字目录资源库建设，对存量档案进行数字化加工，截止2023年底，电子目录39.4万条，扫描纸质档案, 9410卷，104.8万幅，共计5704.8gb，基本实现了档案目录检索全数字化和部分档案的全文检索；同时，档案馆还建立了照片档案数据库，对老照片进行了数字化扫描，注重电子照片的收集，并将所有照片数据都纳入到数字档案管理系统中，实行统一管理，2021年被评为数字档案馆。
各部门、二级学院和直属单位应配备兼职档案员，具体承办本部门档案材料的收集、整理和向档案馆移交档案等工作，一名负责人分管本部门的档案工作，组织本部门相关人员学习、贯彻档案工作的法律、法规和方针政策，执行学校档案工作规章制度，督促、检查本部门的文件材料归档情况。以档案馆为中心的档案管理网络日渐成熟。
2015年，档案馆开始着手《年鉴》的编纂工作，现已完成2014年至2022年《年鉴》共十卷，《年鉴》生动地反映了学校发展的历史轨迹，是学校各项工作的最为直接、最为真实的历史记录，为学校今后的发展规划提供重要的参考依据。
档案馆一直致力于档案管理的科学化、信息化，不断提升服务水平和服务质量，最大限度地满足广大师生及社会利用的各种需求，在学校党政管理、教学科研、对外交流、编史修志等工作中发挥越来越重要的作用，业已成为学校事业发展不可缺少的组成部分。
